Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP104O60308 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CEP104O60308 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CEP104O60308 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CEP104O60308 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms