Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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J3QQQ9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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J3QQQ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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J3QQQ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QQQ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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J3QQQ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QQQ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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