Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C11orf95C9JLR9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
C11orf95C9JLR9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
C11orf95C9JLR9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C11orf95C9JLR9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C11orf95C9JLR9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms