Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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LINC00587B1AMM8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00587B1AMM8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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