Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NOTOA8MTQ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms