Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA3AA6NCI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms