Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf40-201ENST00000324616 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133216.2-201ENST00000622550 7213 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP19-201ENST00000322569 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP1-201ENST00000226225 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH1-214ENST00000514618 3903 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM16L-201ENST00000395671 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GDAP1-201ENST00000220822 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPAT-201ENST00000264220 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-204ENST00000360561 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1C2-202ENST00000381661 3102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF226-202ENST00000337433 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PADI3-201ENST00000375460 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-204ENST00000354312 2943 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD3-203ENST00000433384 5276 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK10-201ENST00000312350 2396 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC3A1-201ENST00000260649 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms