Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SERINC4-202ENST00000319327 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 VWA5A-202ENST00000392744 2691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAB39L-212ENST00000610540 3692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FPGT-TNNI3K-203ENST00000370899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR61-207ENST00000618721 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GRHL3-204ENST00000361548 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CSGALNACT1-201ENST00000332246 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SVEP1-201ENST00000374461 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF19-205ENST00000564230 2205 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LGR6-201ENST00000255432 3406 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BNC2-210ENST00000545497 3750 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MT2P1-201ENST00000262499 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 C22orf15-201ENST00000305199 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P1Y-201ENST00000306641 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P2Y-201ENST00000306853 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SFTA2-201ENST00000359086 451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms