Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms