Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP8A1Q9Y2Q0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms