Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXD3Q9UJU5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms