Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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