Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPMQ9NSP4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPMQ9NSP4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms