Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AKIP1Q9NQ31 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms