Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP29Q9HBJ7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms