Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM54Q9BYV2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM54Q9BYV2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms