Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCGF6Q9BYE7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCGF6Q9BYE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms