Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms