Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDHD3Q9BSH5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms