Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms