Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3AQ96ST3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3AQ96ST3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms