Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PKNOX2Q96KN3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKNOX2Q96KN3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms