Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EAF1Q96JC9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms