Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MS4A3Q96HJ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms