Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFT1Q96AA3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms