Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATRIPQ8WXE1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRIPQ8WXE1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms