Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q8N402 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q8N402 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q8N402 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q8N402 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q8N402 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N402 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N402 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q8N402 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms