Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
YTHDF3Q7Z739 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms