Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM179Q6ZVK1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM179Q6ZVK1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms