Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRAIDQ6UW56 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRAIDQ6UW56 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms