Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT80Q6KB66 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms