Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG16L1Q676U5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms