Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MS4A13Q5J8X5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A13Q5J8X5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A13Q5J8X5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms