Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP29Q52LW3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP29Q52LW3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms