Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF3Q3KNV8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms