Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NRF1Q16656 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms