Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SGCAQ16586 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCAQ16586 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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