Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SF3A1Q15459 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SF3A1Q15459 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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