Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLINT1Q14677 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms