Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCIRG1Q13488 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCIRG1Q13488 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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