Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HSPB3Q12988 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSPB3Q12988 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms