Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms