Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms