Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCT2P78371 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCT2P78371 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT2P78371 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms