Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERVK_113P63121 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERVK_113P63121 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms