Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
ROMO1P60602 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms