Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB25P57735 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms