Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHB4P54760 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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