Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PGGT1BP53609 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PGGT1BP53609 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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