Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP5P51878 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASP5P51878 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP5P51878 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP5P51878 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP5P51878 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP5P51878 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms